№ 1
Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области технических наук и в области технологий, кроме биотехнологии
- Классификатор
- КТРУ: 72.19.20.000-00000001 · Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области технических наук и в области технологий, кроме биотехнологии
- Характеристики
- Цель и задачи НИР: Целью НИР Создание прототипа тест-системы для оценки биомаркеров старения на основе аптамеров Задачи НИР: 1. Синтезировать аптамеры на основе in silico предсказания. 2. Валидировать для предсказанных аптамеров аффинность к целевому белку (белку-мишени) или показать отсутствие таковой аффинности. 3. Создать прототип сэндвич-формата апатмер/аптамер-фермент и/или антитело/аптамер-фермент для одной мишени-биомаркера старения. Указание по заполнению: Значение характеристики не может изменяться участником закупки.
- Условия выполнения НИР: 1) Заказчик передает кандидатные нуклеотидные последовательности, полученные из литературных данных и/или in silico предсказанием. 2) Переданные последовательности должны соответствовать критерию минимальной аффинности, а именно по результатам оценки аффинности методом BLI максимальное значение KD, выше которого аптамер считается неподходящим, должно определяться как не превышающее 70 нМ. 3) Аптамеры, удовлетворяющие условиям п.2 будут использоваться для отработки сэндвич-формата аптамер/аптамер-фермент и/или антитело/аптамер-фермент для одной мишени MMP2 или PCSK9. 4) Исполнитель осуществляет закупку необходимых реагентов и расходных материалов. Указание по заполнению: Значение характеристики не может изменяться участником закупки.
- Содержание под-этапов исполнения НИР: Исследования осуществляются в соответствии с Календарным планом работ и выполняются в 1 (один) этап, 2 (два) под-этапа. Содержание работ включает: 1.Синтез 5 кандидатных пар ДНК аптамеров к 7 мишеням (sRAGE, IL-6, PCSK9, MMP2, MMP9, MMP10, Endocan (ESM1)), для всех мишеней немеченные, а для MMP2 и/или PCSK9 конъюгированные с биотином и/или флуоресцентной меткой. (срок выполнения 70 календарных дней). 2.Проведение Biolayer Interferometry (BLI) для проверки связывающей способности синтезированных неконъюгированных аптамеров. (срок выполнения 80 календарных дней). Указание по заполнению: Значение характеристики не может изменяться участником закупки.
- Порядок сдачи-приемки результатов Работы: По окончании работы Исполнитель оформляет отчетную документацию. Отчетная документация представляется на русском языке с подписью руководителя организации Исполнителя работ и печатью организации. В отчете в обязательном порядке должны быть указаны параметры кинетики связывания (Kon и Koff) и значения аффинности (KD). Результаты работы должны быть представлены Заказчику в виде заключительного отчета о выполненной работе по ГОСТ 7.32-2017 (в одном экземпляре в машинописном виде и в одном экземпляре – в электронном виде). Указание по заполнению: Значение характеристики не может изменяться участником закупки.
- Требования к выполнению НИР: В ходе выполнения НИР: 1) Синтез как минимум 5 пар неконъюгированных аптамеров для каждой мишени (sRAGE, IL-6, PCSK9, MMP2, MMP9, MMP10, ESM1). 2) Закупка необходимых расходных материалов: прозрачные круглодонные 96-луночные планшеты NucleoLink или аналогичные стрипы Закупка необходимых реагентов: рекомбинантные белки, полученные в клеточных линиях млекопитающих, ИФА наборы для Matrix Metalloproteinase 2 (MMP2) и/или PCSK9 3) Получение рекомбинантных белков sRAGE, IL-6, MMP2, MMP9, MMP10, ESM1 4) Оценка методом BLI связывающей способности неконъюгированных аптамеров с His-tag или биотинилированными белками, выбор аптамеров с наибольшей аффинностью 5) Получение конъюгированных аптамеров с высокой аффинностью для MMP2 и/или PCSK9 6) Отработка сэндвич-формата аптамер/аптамер-фермент и/или аптамер/антитело-фермент и/или антитело/аптамер-фермент для одной мишени MMP2 или PCSK9. 7) Сравнение прототипа с референсными ИФА тест-системами (ММP2/PCSK9). Указание по заполнению: Значение характеристики не может изменяться участником закупки.
- Перечень этапов, содержание: Работы будут произведены в один этап общей длительностью 150 (сто пятьдесят) календарных дней. Перечень и содержание под-этапов приведены в Приложении к настоящему Техническому заданию (Календарный план выполнения работ). Указание по заполнению: Значение характеристики не может изменяться участником закупки.
Показать ещё 1
- Ожидаемые результаты НИР: По результатам каждого под-этапа выполнения НИР Заказчику будет предоставлен отчет с приложением результатов исследования, сопровождённый анализом и интерпретацией полученных результатов по каждому этапу, а именно: 1. Для каждого из 7 белков-мишеней должно быть синтезировано 5 пар аптамеров, соответствующих кандидатным нуклеотидным последовательностям, переданным Заказчиком. 2. Для каждого аптамера должна быть исследована аффинность к соответствующему ему белку-мишени или установлено отсутствие таковой аффинности. В отчете в обязательном порядке должны быть указаны параметры кинетики связывания (Kon и Koff) и значения аффинности (KD) согласно обсчету полученных кривых ассоциации-диссоциации программным обеспечением Octet BLI Analysis 12 либо Octet Analysis Studio 12. Указание по заполнению: Значение характеристики не может изменяться участником закупки.
- Количество
- 1 Условная единица
- Распределение по заказчикам
- Распределение отсутствует в XML
- Цена
- 10 670 000,00 руб. за единицуВсего 10 670 000,00 руб.
- Дополнительные признаки
- Преимущество российским товарам